Protein–RNA interactions for Protein: Q03692

COL10A1, Collagen alpha-1(X) chain, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL10A1Q03692 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COL10A1Q03692 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COL10A1Q03692 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms