Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLC25A11Q02978 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC25A11Q02978 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms