Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CYP4A11Q02928 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms