Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OTUD4Q01804 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
OTUD4Q01804 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms