Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLTCQ00610 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLTCQ00610 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms