Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VLDLRP98155 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VLDLRP98155 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms