Protein–RNA interactions for Protein: P79483

HLA-DRB3, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB3P79483 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DRB3P79483 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms