Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-24P63145 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-24P63145 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-24P63145 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-24P63145 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-24P63145 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-24P63145 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-24P63145 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-24P63145 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-24P63145 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms