Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERVK_113P62684 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERVK_113P62684 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERVK_113P62684 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERVK_113P62684 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HERVK_113P62684 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms