Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVS71-1P61550 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms