Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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TMEM258P61165 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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TMEM258P61165 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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TMEM258P61165 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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TMEM258P61165 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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TMEM258P61165 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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