Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTBP60709 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTBP60709 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTBP60709 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTBP60709 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTBP60709 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTBP60709 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTBP60709 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTBP60709 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTBP60709 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTBP60709 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTBP60709 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACTBP60709 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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