Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LOXL3P58215 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms