Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB25P57735 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB25P57735 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms