Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GFRA1P56159 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GFRA1P56159 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms