Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP7P55210 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP7P55210 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASP7P55210 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP7P55210 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP7P55210 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms