Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOSBP53539 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOSBP53539 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOSBP53539 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOSBP53539 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOSBP53539 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOSBP53539 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOSBP53539 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms