Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARFIP1P53367 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms