Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNA4P52798 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms