Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCR4P51679 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCR4P51679 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCR4P51679 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCR4P51679 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCR4P51679 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCR4P51679 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCR4P51679 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCR4P51679 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCR4P51679 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCR4P51679 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCR4P51679 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCR4P51679 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCR4P51679 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCR4P51679 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCR4P51679 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCR4P51679 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CCR4P51679 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCR4P51679 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCR4P51679 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCR4P51679 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms