Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DAP3P51398 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DAP3P51398 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DAP3P51398 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms