Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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