Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms