Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NESP48681 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NESP48681 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NESP48681 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NESP48681 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NESP48681 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NESP48681 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NESP48681 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NESP48681 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NESP48681 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NESP48681 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NESP48681 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NESP48681 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NESP48681 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NESP48681 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NESP48681 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NESP48681 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NESP48681 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NESP48681 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NESP48681 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NESP48681 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NESP48681 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
NESP48681 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NESP48681 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NESP48681 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NESP48681 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms