Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP5P45974 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP5P45974 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP5P45974 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP5P45974 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP5P45974 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms