Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSFMP43897 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSFMP43897 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TSFMP43897 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TSFMP43897 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TSFMP43897 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TSFMP43897 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms