Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TGFBR1P36897 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms