Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA7P36544 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA7P36544 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA7P36544 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA7P36544 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA7P36544 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA7P36544 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA7P36544 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA7P36544 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms