Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXD12P35452 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms