Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFTPDP35247 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms