Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXD10P28358 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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