Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MARK3P27448 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MARK3P27448 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MARK3P27448 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MARK3P27448 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MARK3P27448 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MARK3P27448 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MARK3P27448 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MARK3P27448 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MARK3P27448 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MARK3P27448 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MARK3P27448 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MARK3P27448 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms