Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IL3RAP26951 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms