Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA4P25789 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms