Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2B4P23634 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2B4P23634 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms