Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPRR1BP22528 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms