Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PVALBP20472 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PVALBP20472 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PVALBP20472 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PVALBP20472 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms