Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP2B1P20020 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP2B1P20020 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms