Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCC1P18754 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCC1P18754 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RCC1P18754 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCC1P18754 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCC1P18754 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RCC1P18754 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms