Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTPS1P17812 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms