Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXB9P17482 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms