Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAV1P15498 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAV1P15498 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAV1P15498 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAV1P15498 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAV1P15498 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAV1P15498 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAV1P15498 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAV1P15498 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAV1P15498 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAV1P15498 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms