Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCL2P13500 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCL2P13500 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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