Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DEFA4P12838 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms