Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PTPRCP08575 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms