Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDE8BO95263 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms