Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSO75390 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSO75390 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSO75390 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSO75390 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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