Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL13O43927 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms