Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CREB3O43889 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB3O43889 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB3O43889 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms