Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF208O43345 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms